2009年，黄海水产研究所在农业部、水科院及上级各相关单位的领导下，在兄弟单位的关心、支持下，各项工作取得了显著的成绩。为了更好地总结过去、促进发展，所办公室组织全所职工对2009年度十大亮点进行了评选。

经过全所职工的投票评选，产生了黄海所2009年度十大亮点，分别是：1. 扎实开展学习实践科学发展观活动；2. 王清印研究员、中国工程院院士雷霁霖应邀参加新中国成立60周年国庆庆典观礼，并分别受到胡锦涛总书记等党和国家领导人的亲切接见；客座教授Howell也应邀参加60周年国庆庆典观礼；3. 雷霁霖院士荣获首届青岛市科学技术最高奖；唐启升院士被农业部授予全国农业系统100名“新中国成立60周年‘三农’模范人物”；Howell博士荣获2009年度中国“友谊奖”； 雷霁霖、殷邦忠、杨爱国三人被授予青岛市劳动模范称号；黄倢研究员获得2008年度“山东省有突出贡献的中青年专家”荣誉称号；4. 承办以“可持续海水养殖与提高产出质量的科学问题”为主题的香山科学会议和“海洋生态灾害与生态系统安全”为主题的双清论坛；5. 唐启升院士参加世界自然保护联盟成为渔业专家组成员，对全球自然生态系统的管理提供专业咨询；黄倢研究员被遴选为国际兽疫局水生动物健康标准委员会委员；6. 食品工程与营养研究室正式成立；先后举行水产遗传育种中心、青岛中国对虾良种场、青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室、院士工作站揭牌仪式；7. 离退休干部第一党支部被中共中央组织部授予全国先进离退休干部党支部荣誉称号，并被农业部授予先进离退休干部党支部荣誉称号；8. 基本建设项目“海水养殖遗传育种中心”、“海洋渔业科学实验室改造”、“学术报告厅改造及环境配套工程”通过了农业部组织的竣工验收，其中“海水养殖遗传育种中心”为全国第一个竣工验收的水产遗传育种中心建设项目；9. 全年新上各类科研项目133项；获各级科技奖励10项次；获授权专利13项；发表各类科技论文242篇；10. 青岛金海力水产科技有限公司荣获水科院2009年度科技服务与推广优秀团队荣誉称号；王印庚研究员荣获标兵称号；李健、曲克明、陈松林、孙慧玲和陈超等专家荣获先进个人称号。