近日，由中国水产科学研究院黄海水产研究所纪晓峰等研究发明的“基于进化耦合分析的电压-门控钠离子通道结构模建方法”获国家发明专利授权，专利号：ZL2017111591884。
本发明属于结构生物学领域。首先通过rosetta的膜蛋白同源模建方法，以真核钠离子通道NavPaS(PDBid：5X0M)三级结构为模板，初步构建组成Nav1.5孔道结构域的四个亚基结构。然后通过进化耦合分析的方法(DCA)，评估结构中实际和DCA预测所得的相互作用残基对之间的重合度；结合打分函数，挑选得分和重合度都比较高的结构作为各个结构域的初始结构。然后将挑选出的四个亚基结构组装并进行优化；从优化后的结构中进一步选取界面处重合度和RosettaMP得分都比较高的，以满足评估条件的结构作为最终结构。
本发明克服了传统的结构模建方法没有充分考虑跨膜区域信息及模板同源性低、预测准确性差的缺点，可靠性高。
